En el año de 1954 el Dr. Armando Prado Montiel encabeza a un grupo de profesionistas, que en coordinación con la Secretaria de Salubridad y Asistencia del Estado de Tlaxcala exponen la necesidad de contar con personal calificado de Enfermería, por lo que en 1955 mediante el Decreto 111 del Periódico Oficial No. 40 se autoriza la creación de una Escuela de Enfermería. Siendo Gobernador del Estado el Lic. Joaquín Cisneros Molina y Director de la Escuela Secundaria y Preparatoria del Estado el Dr. Armando Prado Montiel, surge la inquietud de crear el Instituto de Estudios Superiores; iniciativa que es presentada ante el Congreso local, el cual respondió mediante el Decreto No. 145 con fecha 28 de febrero de 1962 del Periódico Oficial No. 9, estableciendo qué: "La Escuela Secundaria y Preparatoria conformarán el Instituto de Estudios Superiores del Estado, además de una Escuela subprofesional, la escuela de Enfermería y Obstetricia". El fundador y primer director de la escuela es el Dr. Armando Prado Montiel, y es el 16 de febrero de 1961, fecha en que dan inicio las actividades de manera oficial en la Escuela de Enfermería.

El 25 de febrero de 1963, siendo Gobernador el C. Anselmo Cervantes Hernández, se emitió el Decreto No. 19, en el que se promulga la Ley Orgánica del Instituto de Estudios Superiores del Estado de Tlaxcala. En dicha Ley, su Artículo 1o establecía que “es una corporación pública con plena capacidad jurídica, que tiene como fin impartir la educación superior para formar profesionales y fomentar la cultura artística que tienda al perfeccionamiento interno del individuo”. Así mismo, en su Artículo 3o señalaba al Instituto de Estudios Superiores del Estado “como un organismo que puede estar constituido por escuelas secundarias, preparatorias y una carrera subprofesional, así como las demás Facultades que posteriormente se funden”; lo señalado en este artículo serviría de base para la futura creación de una Universidad, nuestra Universidad.

Por Decreto No. 95 de fecha 18 de noviembre de 1976, se erigió la Universidad Autónoma de Tlaxcala, como un organismo de servicio público descentralizado, con personalidad jurídica, patrimonio propio y plena autonomía en su régimen jurídico, económico y administrativo. Bajo este nuevo esquema, la Escuela de Enfermería pasó a formar parte de la infraestructura de la Universidad, adquiriendo el nombre de “Departamento de Enfermería y Obstetricia”, siendo su primera Directora la enfermera María de los Ángeles Flores Lira, y como Rector el Dr. Luis Carvajal Espino.

El 17 de diciembre de 1976 se hace entrega del plantel educativo para el funcionamiento del nuevo Departamento, que contaba con cuatro aulas, una biblioteca, un laboratorio de microbiología, una sala de propedéutica, dirección, sanitarios y vestidores. El 12 de febrero de 1977 se agregan a la infraestructura tres aulas, una sala audiovisual y la cafetería. Para ese mismo año 1977, se inicia el primer curso post-básico del nivel técnico sobre Administración de los Servicios de Enfermería. Para marzo de 1980, en convenio con la Escuela Nacional de Enfermería y Obstetricia de la UNAM se crea el Sistema de Universidad Abierta del nivel técnico en su modalidad semipresencial. En el año de 1989 se reestructura el Plan de Estudios de nivel técnico a nivel de Licenciatura, y por consiguiente, nace la Licenciatura en Enfermería y Obstetricia.

Con el propósito de lograr difusión, extensión y servicio a la comunidad, se gestiona la creación de la Clínica Universitaria en 1992, ofreciendo servicios de primer nivel de atención. A partir de una demanda de la población del estado, en el año de 1994 se crea la Licenciatura en Médico General Integral y la Licenciatura en Enfermería y Obstetricia en la modalidad Semipresencial, siendo Director el Dr. Heriberto Quintero Rojas. En 1995 se propone ante el Consejo Departamental y Divisional, el cambio de nombre de Departamento de Enfermería y Obstetricia, por el de “Departamento de Ciencias de la Salud”, con el objetivo de incorporar las licenciaturas existentes y las que pudieran surgir posteriormente del área de la salud, incluyendo opciones de posgrado. En este mismo año se crea la Maestría en Salud Pública.

En 1997 por recomendaciones del CIEES para el Plan de Estudios en Medicina General Integral, se retoma el Plan Único de Estudios de la carrera de Médico Cirujano vigente en la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México. En el año de 1999 nace la Licenciatura en Nutrición, bajo la Dirección de la Licenciada María Elena Perla López Loyo.

En el año 2001 se implementa como Política Institucional la evaluación de los Programas Educativos para retomar el proceso de Acreditación por Organismos Externos de la Educación Superior, se reestructura el plan de Estudios de la Licenciatura en Enfermería y Obstetricia, quedando como Licenciatura en Enfermería y se crea el Plan de estudios de Maestría en Ciencias de la Salud Pública, que reemplaza al Plan de Estudios de Maestría en Salud Pública, bajo la Dirección del MSP. Constantino Vicente Quiroz Pérez; y éstas actividades se continúan bajo la Dirección de la Mtra. Mónica Guadalupe Rodríguez Cortés como Secretaria en Funciones de Directora por Ministerio de Ley.

Con la dirección del Dr. Serafín Ortiz Ortiz al frente de la Rectoría de la Universidad, se generan cambios estructurales necesarios para la vida académica-administrativa, por lo que el nombre de Departamento cambia por el de Facultad, hoy en día recibe el nombre de “Facultad de Ciencias de la Salud”, estos cambios generan una organización interna para el óptimo desempeño. Se avanzó de manera importante en los procesos de Acreditación y Certificación de los Programas Educativos (PE) con la dirección del Dr. Alfredo Adán Pimentel en el 2005.

En la administración de la MSP. Bernarda Sánchez Flores se logró la Certificación de los procesos académicos-administrativos bajo la norma el ISO 9001-2000 y la acreditación del PE en Enfermería en 2007; el Plan de Estudios en Enfermería y Obstetricia en su modalidad semipresencial se reestructuró a un año; se fortaleció la infraestructura en los PE en Médico cirujano y Nutrición; así mismo se inició la gestión para la construcción del edificio que alberga el PE en Enfermería.

En 2010, durante la gestión de la MSP María del Rosario Ruth López Loyo, se inauguró el edificio del PE en Enfermería.

En la Administración del Dr. Alfredo Adán Pimentel, se reestructuró el Plan de Estudios de Maestría en Ciencias de la Salud Pública y se acreditó el PE en Médico Cirujano; además, se adquirió un vehículo de apoyo a las actividades académicas y extensión de servicios de la Facultad. En la dirección del Dr. José Ezequiel Muñoz Flores (agosto 2011) se remodelaron y equiparon áreas en los Programas Educativos en Enfermería, Médico Cirujano y Nutrición. Además, los edificios fueron remozados en su exterior con los colores y logotipo institucionales, así como embellecimiento de áreas verdes.

A partir de septiembre 2011, bajo la Dirección del MSP. Constantino Vicente Quiroz Pérez se culminó la acreditación del PE en Nutrición y se Re-Acreditó el PE en Enfermería. Se diseñaron e implementaron los Planes de Estudio 2012 en los diferentes PE(s) bajo el Modelo Humanista Integrador basado en Competencias. En 2013 inician el PE en Química Clínica y Maestría en Enfermería. En el PE en Médico Cirujano se construyeron aulas y en el PE en Enfermería se fortalecieron los laboratorios.

Bajo la dirección del MSP. Carlos Braulio Nava Cruz, en 2017 se obtuvo la Re-acreditación de los PE en Médico Cirujano y Nutrición con el compromiso de elevar la calidad educativa de los profesionistas del área de la salud. Así mismo, se recibió apoyo para la construcción y equipamiento de aulas, baños y un Laboratorio de propedéutica dando así cumplimiento a las recomendaciones de organismos acreditadores. De igual forma, se ha apoyado a todos PE(s) de la Facultad con equipo de cómputo y mobiliario de oficina.

En la dirección del Dr. Olaf Molina García, como Director encargado se actualizaron e implementan los Planes y Programas de estudio bajo el Modelo Humanista Integrador por Competencias versión 2018 en los PE de Licenciatura de la Facultad, resultado de la reestructuración el PE en Enfermería cambió de denominación a Enfermería y Obstetricia; además, se obtiene por tercera vez la re- acreditación de PE en Enfermería.

Mientras que bajo la Dirección de la Dra. Senobia Rosalía Cruz Lumbreras, se inauguro el edificio para el Programa Educativo en Química Clínica, se construyó un almacén para materiales y reactivos de laboratorio; así como, recuperación y habilitación del terreno adjunto al PE en Médico Cirujano propiedad de la facultad. Así mismo, se continua con el compromiso de elevar la calidad de sus PE(s); mediante su acreditación y certificación de los procesos administrativos en la facultad. Por otra parte, se crean dos nuevas especialidades: la Especialidad en Salud Pública y la Especialidad en Enfermería Perinatal y posteriormente se crea el Programa Educativo en Fisioterapia.

A partir del mes de abril de 2023, la Dra. Aurora García García asume la Dirección como directora encargada, periodo en el cual se reinauguró el edificio II del programa educativo en Médico Cirujano; y en agosto del mismo año, el MSP. José Francisco Mauricio García es nombrado como actual Director de la Facultad de Ciencias de la Salud.

La Facultad de Ciencias de la Salud (FCS) con 63 años de vida es reconocida como la institución formadora de recursos humanos en salud más importante del estado, ha logrado constituirse en la opción preferencial para muchos estudiantes que aspiran a estudiar, bajo los conceptos de excelencia, innovación y calidad.

La Facultad de Ciencias de la Salud actualmente ofrece 5 Programas Educativos(PE) de Licenciatura: Enfermería y Obstetricia, Médico Cirujano, Nutrición, Química Clínica y Fisioterapia, además de 3 Programas Educativos de Posgrado: Maestría en Ciencias de la Salud Pública; Especialidad en Salud Pública; Especialidad en Enfermería Perinatal. Los cuales son ofertados en dos Unidades Académicas ubicadas en los municipios Zacatelco y San Pablo de Monte.

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